При воздействии на микроорганизмы, в том числе на дрожжи, локально повреждается мембрана, что приводит к их гибели или невозможности размножаться. Отмечено повышение чувствительности микроорганизмов к антибиотикам. Экспериментально установлено, что газообразный озон убивает все виды бактерий, вирусов, плесневых и дрожжевых грибов и простейших. Время действия озона от 5 минут до одного часа.